Pyrimidine-specific ribonucleoside hydrolase rihB (P33022)
Identification | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Name: | Pyrimidine-specific ribonucleoside hydrolase rihB | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms: |
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Gene Name: | rihB | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Enzyme Class: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Properties | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
General Function: | Involved in hydrolase activity, hydrolyzing N-glycosyl compounds | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Specific Function: | Hydrolyzes cytidine or uridine to ribose and cytosine or uracil, respectively. Has a clear preference for cytidine over uridine. Strictly specific for ribonucleosides. Has a low but significant activity for the purine nucleoside xanthosine | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Location: | Cytoplasmic | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMPDB Pathways: |
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KEGG Pathways: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG Reactions: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Complex Reactions: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Metabolites: |
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GO Classification: |
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Gene Properties | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Blattner: | b2162 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Orientation | Counterclockwise | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Centisome Percentage: | 48.54 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Left Sequence End | 2252267 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Right Sequence End | 2253208 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Sequence: | >942 bp ATGAAGCTGATACGCGGCATACATAATCTCAGCCAGGCCCCGCAAGAAGGGTGTGTGCTG ACTATTGGTAATTTCGACGGCGTGCATCGCGGTCATCGCGCGCTGTTACAGGGCTTGCAG GAAGAAGGGCGCAAGCGCAACTTACCGGTGATGGTGATGCTTTTTGAACCTCAACCACTG GAACTGTTTGCTACCGATAAAGCCCCGGCAAGACTGACCCGGCTGCGGGAAAAACTGCGT TACCTTGCAGAGTGTGGCGTTGATTACGTGCTGTGCGTGCGTTTCGACAGGCGTTTCGCG GCGTTAACCGCGCAAAATTTCATCAGCGATCTTCTGGTGAAGCATTTGCGCGTAAAATTT CTTGCCGTAGGTGATGATTTCCGCTTTGGCGCTGGTCGTGAAGGCGATTTCTTGTTATTA CAGAAAGCTGGCATGGAATACGGCTTCGATATCACCAGTACGCAAACTTTTTGCGAAGGT GGCGTGCGCATCAGCAGCACCGCCGTGCGTCAGGCCCTTGCGGATGACAATCTGGCTCTG GCAGAGAGTTTACTGGGGCACCCGTTTGCCATCTCCGGGCGTGTAGTCCACGGTGATGAA TTAGGGCGCACTATAGGTTTCCCGACGGCGAATGTACCGCTGCGCCGTCAGGTTTCCCCG GTGAAAGGGGTTTATGCGGTAGAAGTGCTGGGCCTCGGTGAAAAGCCGTTACCCGGCGTG GCAAACATCGGAACACGCCCAACGGTTGCCGGTATTCGCCAGCAGCTGGAAGTGCATTTG TTAGATGTTGCAATGGACCTTTACGGTCGCCATATACAAGTAGTGCTGCGTAAAAAAATA CGCAATGAGCAGCGATTTGCGTCGCTGGACGAACTGAAAGCGCAGATTGCGCGTGATGAA TTAACCGCCCGCGAATTTTTTGGGCTAACAAAACCGGCTTAA | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Properties | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pfam Domain Function: |
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Protein Residues: | 313 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Molecular Weight: | 33748 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Theoretical pI: | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB File: | 1Q8F | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Signaling Regions: |
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Transmembrane Regions: |
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Protein Sequence: | >Pyrimidine-specific ribonucleoside hydrolase rihB MEKRKIILDCDPGHDDAIAIMMAAKHPAIDLLGITIVAGNQTLDKTLINGLNVCQKLEIN VPVYAGMPQPIMRQQIVADNIHGETGLDGPVFEPLTRQAESTHAVKYIIDTLMASDGDIT LVPVGPLSNIAVAMRMQPAILPKIREIVLMGGAYGTGNFTPSAEFNIFADPEAARVVFTS GVPLVMMGLDLTNQTVCTPDVIARMERAGGPAGELFSDIMNFTLKTQFENYGLAGGPVHD ATCIGYLINPDGIKTQEMYVEVDVNSGPCYGRTVCDELGVLGKPANTKVGITIDTDWFWG LVEECVRGYIKTH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Links: |
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General Reference: |
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