
2-Dehydro-3-deoxy-D-glucarate (ECMDB20040) (M2MDB000889)
Record Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Version | 2.0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Creation Date | 2012-05-31 14:24:18 -0600 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Update Date | 2015-06-03 17:19:11 -0600 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary Accession Numbers |
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Identification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Name: | 2-Dehydro-3-deoxy-D-glucarate | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | 2-dehydro-3-deoxy-D-glucarate is a member of the chemical class known as Hexoses. These are monosaccharides in which the sugar unit is a hexose. It is a substrate for 2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase (EC 4.1.2.20) which is an enzyme that catalyzes the chemical reaction: 2-dehydro-3-deoxy-D-glucarate = pyruvate + tartronate semialdehyde | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms: |
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Chemical Formula: | C6H8O7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Weight: | Average: 192.1235 Monoisotopic: 192.02700261 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Key: | QUURPCHWPQNNGL-OKKQSCSOSA-N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI: | InChI=1S/C6H8O7/c7-2(4(9)6(12)13)1-3(8)5(10)11/h2,4,7,9H,1H2,(H,10,11)(H,12,13)/t2-,4-/m0/s1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CAS number: | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IUPAC Name: | (2S,3S)-2,3-dihydroxy-5-oxohexanedioic acid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Traditional IUPAC Name: | 2-dehydro-3-deoxy-D-glucarate | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMILES: | [H][C@](O)(CC(=O)C(O)=O)[C@]([H])(O)C(O)=O | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemical Taxonomy | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | belongs to the class of organic compounds known as medium-chain keto acids and derivatives. These are keto acids with a 6 to 12 carbon atoms long side chain. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kingdom | Organic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Super Class | Organic acids and derivatives | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Class | Keto acids and derivatives | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sub Class | Medium-chain keto acids and derivatives | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Direct Parent | Medium-chain keto acids and derivatives | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alternative Parents | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Substituents |
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Molecular Framework | Aliphatic acyclic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Descriptors |
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Physical Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
State: | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Charge: | -2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Melting point: | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental Properties: |
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Predicted Properties |
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Biological Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Locations: | Cytoplasm | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Reactions: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMPDB Pathways: |
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KEGG Pathways: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EcoCyc Pathways: | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Concentrations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Spectra | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Spectra: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References: |
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Synthesis Reference: | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Material Safety Data Sheet (MSDS) | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Links | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Links: |
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Enzymes
- General function:
- Involved in magnesium ion binding
- Specific function:
- Catalyzes the dehydration of glucarate to 5-keto-4- deoxy-D-glucarate (5-kdGluc). Also acts on L-idarate
- Gene Name:
- gudD
- Uniprot ID:
- P0AES2
- Molecular weight:
- 49141
Reactions
D-glucarate = 5-dehydro-4-deoxy-D-glucarate + H(2)O. |
- General function:
- Involved in carbon-carbon lyase activity
- Specific function:
- Catalyzes the reversible retro-aldol cleavage of both 5- keto-4-deoxy-D-glucarate and 2-keto-3-deoxy-D-glucarate to pyruvate and tartronic semialdehyde
- Gene Name:
- garL
- Uniprot ID:
- P23522
- Molecular weight:
- 27384
Reactions
5-dehydro-4-deoxy-D-glucarate = pyruvate + tartronate semialdehyde. |
2-dehydro-3-deoxy-D-glucarate = pyruvate + tartronate semialdehyde. |