D-Arabinose 5-phosphate (ECMDB11734) (M2MDB000821)
Record Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Version | 2.0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Creation Date | 2012-05-31 14:20:39 -0600 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Update Date | 2015-09-13 12:56:14 -0600 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary Accession Numbers |
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Identification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Name: | D-Arabinose 5-phosphate | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | D-Arabinose 5-phosphate is an intermediate in biosynthesis of lipopolysaccharide. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms: |
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Chemical Formula: | C5H11O8P | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Weight: | Average: 230.1098 Monoisotopic: 230.01915384 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Key: | PPQRONHOSHZGFQ-WDCZJNDASA-N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI: | InChI=1S/C5H11O8P/c6-1-3(7)5(9)4(8)2-13-14(10,11)12/h1,3-5,7-9H,2H2,(H2,10,11,12)/t3-,4-,5+/m1/s1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CAS number: | 13137-52-5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IUPAC Name: | {[(2R,3R,4S)-2,3,4-trihydroxy-5-oxopentyl]oxy}phosphonic acid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Traditional IUPAC Name: | arabinose 5-phosphate | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMILES: | O[C@H](COP(O)(O)=O)[C@@H](O)[C@H](O)C=O | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemical Taxonomy | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | belongs to the class of organic compounds known as pentose phosphates. These are carbohydrate derivatives containing a pentose substituted by one or more phosphate groups. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kingdom | Organic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Super Class | Organic oxygen compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Class | Organooxygen compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sub Class | Carbohydrates and carbohydrate conjugates | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Direct Parent | Pentose phosphates | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alternative Parents | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Substituents |
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Molecular Framework | Aliphatic acyclic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Descriptors |
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Physical Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
State: | Solid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Charge: | -2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Melting point: | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental Properties: |
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Predicted Properties |
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Biological Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Locations: | Cytoplasm | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Reactions: | D-Ribulose 5-phosphate <> D-Arabinose 5-phosphate D-Arabinose 5-phosphate + Water + Phosphoenolpyruvic acid <> 3-Deoxy-D-manno-octulosonate 8-phosphate + Phosphate 3-Deoxy-D-manno-octulosonate 8-phosphate + Phosphate <> Phosphoenolpyruvic acid + D-Arabinose 5-phosphate + Water D-Arabinose 5-phosphate <> D-Ribulose 5-phosphate D-Arabinose 5-phosphate + Water + Phosphoenolpyruvic acid > 3-Deoxy-D-manno-octulosonate 8-phosphate + Phosphate D-Arabinose 5-phosphate > D-Ribulose 5-phosphate Phosphoenolpyruvic acid + D-Arabinose 5-phosphate + Water > 3-Deoxy-D-manno-octulosonate 8-phosphate + Inorganic phosphate D-Ribulose 5-phosphate > D-Arabinose 5-phosphate D-Arabinose 5-phosphate + Phosphoenolpyruvic acid + Water > Phosphate + 3-deoxy-D-manno-octulosonate 8-phosphate + 3-Deoxy-D-manno-octulosonate 8-phosphate D-Arabinose 5-phosphate + Water + Phosphoenolpyruvic acid <>3 3-Deoxy-D-manno-octulosonate 8-phosphate + Phosphate D-Arabinose 5-phosphate <> D-Ribulose 5-phosphate D-Arabinose 5-phosphate + Water + Phosphoenolpyruvic acid <>3 3-Deoxy-D-manno-octulosonate 8-phosphate + Phosphate D-Arabinose 5-phosphate <> D-Ribulose 5-phosphate | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMPDB Pathways: |
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KEGG Pathways: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EcoCyc Pathways: |
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Concentrations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Find out more about how we convert literature concentrations. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Spectra | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Spectra: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References: |
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Synthesis Reference: | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Material Safety Data Sheet (MSDS) | Download (PDF) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Links | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Links: |
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Enzymes
- General function:
- Involved in catalytic activity
- Specific function:
- Synthesis of KDO 8-P which is required for lipid A maturation and cellular growth
- Gene Name:
- kdsA
- Uniprot ID:
- P0A715
- Molecular weight:
- 30833
Reactions
Phosphoenolpyruvate + D-arabinose 5-phosphate + H(2)O = 2-dehydro-3-deoxy-D-octonate 8-phosphate + phosphate. |
- General function:
- Involved in protein binding
- Specific function:
- Catalyzes the interconversion of D-arabinose 5-phosphate and D-ribulose 5-phosphate
- Gene Name:
- kdsD
- Uniprot ID:
- P45395
- Molecular weight:
- 35196
Reactions
D-arabinose 5-phosphate = D-ribulose 5-phosphate. |
- General function:
- Involved in catalytic activity
- Specific function:
- Specific function unknown
- Gene Name:
- gutQ
- Uniprot ID:
- P17115
- Molecular weight:
- 34031
Reactions
D-arabinose 5-phosphate = D-ribulose 5-phosphate. |