2-Dehydro-3-deoxy-D-galactonate (ECMDB04044) (M2MDB000577)
Record Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Version | 2.0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Creation Date | 2012-05-31 14:03:13 -0600 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Update Date | 2015-09-17 15:42:01 -0600 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary Accession Numbers |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Identification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Name: | 2-Dehydro-3-deoxy-D-galactonate | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | 2-Dehydro-3-deoxy-D-galactonate is a carbohydrate acid. It is an intermediate in carbohydrate-acid metabolism and D-galactonate metabolism. It is a substrate for 2-dehydro-3-deoxygalactonokinase which catalyzes the following reaction: ATP + 2-dehydro-3-deoxy-D-galactonate = ADP + 2-dehydro-3-deoxy-D-galactonate 6-phosphate. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms: |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemical Formula: | C6H9O6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Weight: | Average: 177.133 Monoisotopic: 177.04046159 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Key: | WPAMZTWLKIDIOP-UHFFFAOYSA-M | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI: | InChI=1S/C6H10O6/c7-2-5(10)3(8)1-4(9)6(11)12/h3,5,7-8,10H,1-2H2,(H,11,12)/p-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CAS number: | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IUPAC Name: | (4R,5R)-4,5,6-trihydroxy-2-oxohexanoic acid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Traditional IUPAC Name: | (4R,5R)-4,5,6-trihydroxy-2-oxohexanoic acid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMILES: | OCC(O)C(O)CC(=O)C([O-])=O | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemical Taxonomy | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | belongs to the class of organic compounds known as medium-chain keto acids and derivatives. These are keto acids with a 6 to 12 carbon atoms long side chain. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kingdom | Organic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Super Class | Organic acids and derivatives | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Class | Keto acids and derivatives | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sub Class | Medium-chain keto acids and derivatives | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Direct Parent | Medium-chain keto acids and derivatives | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alternative Parents | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Substituents |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Framework | Aliphatic acyclic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Descriptors |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Physical Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
State: | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Charge: | -1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Melting point: | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental Properties: |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Properties |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Locations: | Cytoplasm | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Reactions: | 2-Dehydro-3-deoxy-D-galactonate + Adenosine triphosphate <> 2-Dehydro-3-deoxy-D-galactonate-6-phosphate + ADP + Hydrogen ion Galactonic acid <> 2-Dehydro-3-deoxy-D-galactonate + Water Adenosine triphosphate + 2-Dehydro-3-deoxy-D-galactonate <> ADP + 2-Dehydro-3-deoxy-D-galactonate-6-phosphate 2-Dehydro-3-deoxy-D-galactonate + Adenosine triphosphate > Hydrogen ion + 2-Dehydro-3-deoxy-D-galactonate-6-phosphate + ADP D-Galactonate > Water + 2-Dehydro-3-deoxy-D-galactonate Galactonic acid > 2-Dehydro-3-deoxy-D-galactonate + Water Adenosine triphosphate + 2-Dehydro-3-deoxy-D-galactonate > ADP + 2-Dehydro-3-deoxy-D-galactonate 6-phosphate Galactonic acid + Galactonic acid > Water + 2-dehydro-3-deoxy-D-galactonate + 2-Dehydro-3-deoxy-D-galactonate 2-dehydro-3-deoxy-D-galactonate + Adenosine triphosphate + 2-Dehydro-3-deoxy-D-galactonate > Adenosine diphosphate + Hydrogen ion + 2-dehydro-3-deoxy-D-galactonate 6-phosphate + ADP + 2-Dehydro-3-deoxy-D-galactonate 6-phosphate D-altronate > Water + 2-Dehydro-3-deoxy-D-galactonate + 2-Keto-3-deoxy-D-gluconic acid D-altronate + D-altronate > Water + 2-Dehydro-3-deoxy-D-galactonate + 2-Keto-3-deoxy-D-gluconic acid 2-Dehydro-3-deoxy-D-galactonate + Adenosine triphosphate + 2-Keto-3-deoxy-D-gluconic acid > Hydrogen ion + 2-Keto-3-deoxy-6-phosphogluconic acid + Adenosine diphosphate + ADP | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMPDB Pathways: |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG Pathways: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EcoCyc Pathways: |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Concentrations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Spectra | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Spectra: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References: |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synthesis Reference: | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Material Safety Data Sheet (MSDS) | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Links | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Links: |
|
Enzymes
- General function:
- Carbohydrate transport and metabolism
- Specific function:
- ATP + 2-dehydro-3-deoxy-D-galactonate = ADP + 2-dehydro-3-deoxy-D-galactonate 6-phosphate
- Gene Name:
- dgoK
- Uniprot ID:
- P31459
- Molecular weight:
- 31373
Reactions
ATP + 2-dehydro-3-deoxy-D-galactonate = ADP + 2-dehydro-3-deoxy-D-galactonate 6-phosphate. |
- General function:
- Involved in galactonate dehydratase activity
- Specific function:
- Catalyzes the dehydration of D-galactonate to 2-keto-3- deoxy-D-galactonate
- Gene Name:
- dgoD
- Uniprot ID:
- Q6BF17
- Molecular weight:
- 42523
Reactions
D-galactonate = 2-dehydro-3-deoxy-D-galactonate + H(2)O. |