Crotonoyl-CoA (ECMDB02009) (M2MDB000429)
Record Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Version | 2.0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Creation Date | 2012-05-31 13:55:02 -0600 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Update Date | 2015-06-03 15:54:13 -0600 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary Accession Numbers |
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Identification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Name: | Crotonoyl-CoA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | Crotonoyl-CoA is an important component in several metabolic pathways, notably fatty acid and amino acid metabolism. It is the substrate of a group of enzymes acyl-Coenzyme A oxidases 1, 2, 3 (E.C.: 1.3.3.6) corresponding to palmitoyl, branched chain, and pristanoyl, respectively, in the peroxisomal fatty acid beta-oxidation, producing hydrogen peroxide. It is also a substrate of a group of enzymes called acyl-Coenzyme A dehydrogenase (E.C.:1.3.99-, including 1.3.99.2, 1.3.99.3) in the metabolism of fatty acids. In addition, crotonoyl-CoA is the substrate of enoyl coenzyme A hydratase (E.C.4.2.1.17) during lysine degradation and tryptophan metabolism, benzoate degradation via CoA ligation; in contrast it is the product of this enzyme in the butanoate metabolism. Moreover, it is produced from multiple enzymes in the butanoate metabolism pathway, including 3-Hydroxybutyryl-CoA dehydratase (E.C.:4.2.1.55), glutaconyl-CoA decarboxylase (E.C.: 4.1.1.70), vinylacetyl-CoA delta-isomerase (E.C.: 5.3.3.3), and trans-2-enoyl-CoA reductase (NAD+) (E.C.: 1.3.1.44). In lysine degradation and tryptophan metabolism, crotonoyl CoA is produced by glutaryl-Coenzyme A dehydrogenase (E.C.:1.3.99.7) lysine and tryptophan metabolic pathway. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms: |
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Chemical Formula: | C25H40N7O17P3S | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Weight: | Average: 835.608 Monoisotopic: 835.141423115 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Key: | KFWWCMJSYSSPSK-BOGFJHSMSA-N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI: | InChI=1S/C25H40N7O17P3S/c1-4-5-16(34)53-9-8-27-15(33)6-7-28-23(37)20(36)25(2,3)11-46-52(43,44)49-51(41,42)45-10-14-19(48-50(38,39)40)18(35)24(47-14)32-13-31-17-21(26)29-12-30-22(17)32/h4-5,12-14,18-20,24,35-36H,6-11H2,1-3H3,(H,27,33)(H,28,37)(H,41,42)(H,43,44)(H2,26,29,30)(H2,38,39,40)/b5-4+/t14-,18-,19-,20?,24-/m1/s1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CAS number: | 102680-35-3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IUPAC Name: | {[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-2-{[({[(3-{[2-({2-[(2E)-but-2-enoylsulfanyl]ethyl}carbamoyl)ethyl]carbamoyl}-3-hydroxy-2,2-dimethylpropoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}(hydroxy)phosphoryl)oxy]methyl}-4-hydroxyoxolan-3-yl]oxy}phosphonic acid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Traditional IUPAC Name: | [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-2-({[(3-{[2-({2-[(2E)-but-2-enoylsulfanyl]ethyl}carbamoyl)ethyl]carbamoyl}-3-hydroxy-2,2-dimethylpropoxy(hydroxy)phosphoryl)oxy(hydroxy)phosphoryl]oxy}methyl)-4-hydroxyoxolan-3-yl]oxyphosphonic acid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMILES: | C\C=C\C(=O)SCCNC(=O)CCNC(=O)C(O)C(C)(C)COP(O)(=O)OP(O)(=O)OC[C@H]1O[C@H]([C@H](O)[C@@H]1OP(O)(O)=O)N1C=NC2=C(N)N=CN=C12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemical Taxonomy | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | belongs to the class of organic compounds known as 2-enoyl coas. These are organic compounds containing a coenzyme A substructure linked to a 2-enoyl chain. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kingdom | Organic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Super Class | Lipids and lipid-like molecules | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Class | Fatty Acyls | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sub Class | Fatty acyl thioesters | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Direct Parent | 2-enoyl CoAs | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alternative Parents |
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Substituents |
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Molecular Framework | Aromatic heteropolycyclic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Descriptors | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Physical Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
State: | Solid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Charge: | -4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Melting point: | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental Properties: |
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Predicted Properties |
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Biological Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Locations: | Cytoplasm | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Reactions: | 3-Hydroxybutyryl-CoA <> Crotonoyl-CoA + Water Butyryl-CoA + FAD <> Crotonoyl-CoA + FADH2 Butanoyl-CoA + FAD <> FADH2 + Crotonoyl-CoA (S)-3-Hydroxybutanoyl-CoA <> Crotonoyl-CoA + Water Crotonoyl-CoA + Water <> 3-Hydroxybutanoyl-CoA Crotonoyl-CoA + Water > (3S)-3-hydroxyacyl-CoA + (3S)-3-Hydroxyacyl-CoA Crotonoyl-CoA > Water + 3-Hydroxybutyryl-CoA + 3-Hydroxybutyryl-CoA 3-Hydroxybutyryl-CoA + 3-Hydroxybutyryl-CoA <> Crotonoyl-CoA + Water Butyryl-CoA + electron-transfer flavoprotein + Butyryl-CoA <> Crotonoyl-CoA + Reduced electron-transfer flavoprotein Glutaryl-CoA > Crotonoyl-CoA + Carbon dioxide 3-Hydroxybutyryl-CoA + 3-Hydroxybutyryl-CoA > Crotonoyl-CoA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMPDB Pathways: |
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KEGG Pathways: |
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EcoCyc Pathways: | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Concentrations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Spectra | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Spectra: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References: |
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Synthesis Reference: | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Material Safety Data Sheet (MSDS) | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Links | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Links: |
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Enzymes
- General function:
- Involved in 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase activity
- Specific function:
- Catalyzes the formation of an hydroxyacyl-CoA by addition of water on enoyl-CoA. Also exhibits 3-hydroxyacyl-CoA epimerase and 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase activities. Involved in the aerobic and anaerobic degradation of long-chain fatty acids
- Gene Name:
- fadB
- Uniprot ID:
- P21177
- Molecular weight:
- 79593
Reactions
(S)-3-hydroxyacyl-CoA + NAD(+) = 3-oxoacyl-CoA + NADH. |
(3S)-3-hydroxyacyl-CoA = trans-2(or 3)-enoyl-CoA + H(2)O. |
(S)-3-hydroxybutanoyl-CoA = (R)-3-hydroxybutanoyl-CoA. |
(3Z)-dodec-3-enoyl-CoA = (2E)-dodec-2-enoyl-CoA. |
- General function:
- Involved in catalytic activity
- Specific function:
- Could possibly oxidize fatty acids using specific components
- Gene Name:
- paaF
- Uniprot ID:
- P76082
- Molecular weight:
- 27237
Reactions
(3S)-3-hydroxyacyl-CoA = trans-2(or 3)-enoyl-CoA + H(2)O. |
- General function:
- Involved in 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase activity
- Specific function:
- Catalyzes the formation of an hydroxyacyl-CoA by addition of water on enoyl-CoA. Also exhibits 3-hydroxyacyl-CoA epimerase and 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase activities. Strongly involved in the anaerobic degradation of long and medium-chain fatty acids in the presence of nitrate and weakly involved in the aerobic degradation of long-chain fatty acids
- Gene Name:
- fadJ
- Uniprot ID:
- P77399
- Molecular weight:
- 77072
Reactions
(3S)-3-hydroxyacyl-CoA = trans-2(or 3)-enoyl-CoA + H(2)O. |
(S)-3-hydroxyacyl-CoA + NAD(+) = 3-oxoacyl-CoA + NADH. |
(S)-3-hydroxybutanoyl-CoA = (R)-3-hydroxybutanoyl-CoA. |
- General function:
- Involved in acyl-CoA dehydrogenase activity
- Specific function:
- Catalyzes the dehydrogenation of acyl-CoA
- Gene Name:
- fadE
- Uniprot ID:
- Q47146
- Molecular weight:
- 89224
Reactions
An acyl-CoA + FAD = a dehydrogenated acyl-CoA + FADH(2). |
Transporters
- General function:
- Involved in 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase activity
- Specific function:
- Catalyzes the formation of an hydroxyacyl-CoA by addition of water on enoyl-CoA. Also exhibits 3-hydroxyacyl-CoA epimerase and 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase activities. Involved in the aerobic and anaerobic degradation of long-chain fatty acids
- Gene Name:
- fadB
- Uniprot ID:
- P21177
- Molecular weight:
- 79593
Reactions
(S)-3-hydroxyacyl-CoA + NAD(+) = 3-oxoacyl-CoA + NADH. |
(3S)-3-hydroxyacyl-CoA = trans-2(or 3)-enoyl-CoA + H(2)O. |
(S)-3-hydroxybutanoyl-CoA = (R)-3-hydroxybutanoyl-CoA. |
(3Z)-dodec-3-enoyl-CoA = (2E)-dodec-2-enoyl-CoA. |