N2-Succinyl-L-ornithine (ECMDB01199) (M2MDB000295)
Record Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Version | 2.0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Creation Date | 2012-05-31 13:47:30 -0600 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Update Date | 2015-06-03 15:53:50 -0600 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary Accession Numbers |
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Identification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Name: | N2-Succinyl-L-ornithine | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | N2-Succinyl-L-ornithine is a substrate for Ornithine aminotransferase (mitochondrial). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms: |
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Chemical Formula: | C9H16N2O5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Weight: | Average: 232.2337 Monoisotopic: 232.105921632 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Key: | VWXQFHJBQHTHMK-LURJTMIESA-N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI: | InChI=1S/C9H16N2O5/c10-5-1-2-6(9(15)16)11-7(12)3-4-8(13)14/h6H,1-5,10H2,(H,11,12)(H,13,14)(H,15,16)/t6-/m0/s1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CAS number: | 899816-95-6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IUPAC Name: | (2S)-5-amino-2-(3-carboxypropanamido)pentanoic acid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Traditional IUPAC Name: | N(2)-succinyl-L-ornithine | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMILES: | NCCC[C@H](NC(=O)CCC(O)=O)C(O)=O | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemical Taxonomy | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | belongs to the class of organic compounds known as n-acyl-alpha amino acids. N-acyl-alpha amino acids are compounds containing an alpha amino acid which bears an acyl group at its terminal nitrogen atom. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kingdom | Organic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Super Class | Organic acids and derivatives | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Class | Carboxylic acids and derivatives | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sub Class | Amino acids, peptides, and analogues | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Direct Parent | N-acyl-alpha amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alternative Parents | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Substituents |
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Molecular Framework | Aliphatic acyclic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Descriptors |
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Physical Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
State: | Solid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Charge: | -1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Melting point: | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental Properties: |
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Predicted Properties |
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Biological Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Locations: | Cytoplasm | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Reactions: | 2 Hydrogen ion + 2 Water + N2-Succinyl-L-arginine > Carbon dioxide +2 Ammonium + N2-Succinyl-L-ornithine alpha-Ketoglutarate + N2-Succinyl-L-ornithine <> L-Glutamate + N2-Succinyl-L-glutamic acid 5-semialdehyde N2-Succinyl-L-arginine + 2 Water <> N2-Succinyl-L-ornithine + Carbon dioxide +2 Ammonia N2-Succinyl-L-arginine + Water > N2-Succinyl-L-ornithine + Ammonia + Carbon dioxide N2-Succinyl-L-ornithine + Oxoglutaric acid > N2-Succinyl-L-glutamic acid 5-semialdehyde + L-Glutamate N2-Succinyl-L-arginine + 2 Water > N2-Succinyl-L-ornithine +2 Ammonia + Carbon dioxide N2-succinyl-L-arginine + 2 Water + 2 Hydrogen ion + N2-succinyl-L-arginine > Carbon dioxide +2 Ammonium + N2-Succinyl-L-ornithine N2-Succinyl-L-ornithine + Oxoglutaric acid > L-Glutamic acid + N2-Succinyl-L-glutamic acid 5-semialdehyde + L-Glutamate N2-Succinyl-L-arginine + 2 Water <> N2-Succinyl-L-ornithine + Carbon dioxide +2 Ammonia N2-Succinyl-L-arginine + 2 Water <> N2-Succinyl-L-ornithine + Carbon dioxide +2 Ammonia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMPDB Pathways: |
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KEGG Pathways: |
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EcoCyc Pathways: |
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Concentrations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Spectra | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Spectra: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References: |
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Synthesis Reference: | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Material Safety Data Sheet (MSDS) | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Links | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Links: |
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Enzymes
- General function:
- Involved in N-succinylarginine dihydrolase activity
- Specific function:
- Catalyzes the hydrolysis of N(2)-succinylarginine into N(2)-succinylornithine, ammonia and CO(2)
- Gene Name:
- astB
- Uniprot ID:
- P76216
- Molecular weight:
- 49298
Reactions
N(2)-succinyl-L-arginine + 2 H(2)O = N(2)-succinyl-L-ornithine + 2 NH(3) + CO(2). |
- General function:
- Involved in transaminase activity
- Specific function:
- Catalyzes the transamination of N(2)-succinylornithine and alpha-ketoglutarate into N(2)-succinylglutamate semialdehyde and glutamate. Can also act as an acetylornithine aminotransferase
- Gene Name:
- astC
- Uniprot ID:
- P77581
- Molecular weight:
- 43665
Reactions
N(2)-succinyl-L-ornithine + 2-oxoglutarate = N-succinyl-L-glutamate 5-semialdehyde + L-glutamate. |