Adenosine diphosphate ribose (ECMDB01178) (M2MDB000285)
Record Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Version | 2.0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Creation Date | 2012-05-31 13:46:56 -0600 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Update Date | 2015-06-03 15:53:48 -0600 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary Accession Numbers |
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Identification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Name: | Adenosine diphosphate ribose | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | Adenosine diphosphate ribose is a member of the chemical class known as Purine Ribonucleoside Diphosphates. These are purine ribobucleotides with diphosphate group linked to the ribose moiety. Adenosine diphosphate ribose is a molecule formed into chains by the enzyme poly ADP ribose polymerase. It binds to and activates the TRPM2 ion channel (WikiPedia) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms: |
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Chemical Formula: | C15H23N5O14P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Weight: | Average: 559.3157 Monoisotopic: 559.071673493 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Key: | SRNWOUGRCWSEMX-KEOHHSTQSA-N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI: | InChI=1S/C15H23N5O14P2/c16-12-7-13(18-3-17-12)20(4-19-7)14-10(23)8(21)5(32-14)1-30-35(26,27)34-36(28,29)31-2-6-9(22)11(24)15(25)33-6/h3-6,8-11,14-15,21-25H,1-2H2,(H,26,27)(H,28,29)(H2,16,17,18)/t5-,6-,8-,9-,10-,11-,14-,15-/m1/s1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CAS number: | 20762-30-5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IUPAC Name: | [({[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methoxy}(hydroxy)phosphoryl)oxy]({[(2R,3S,4R,5R)-3,4,5-trihydroxyoxolan-2-yl]methoxy})phosphinic acid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Traditional IUPAC Name: | {[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methoxy(hydroxy)phosphoryl}oxy[(2R,3S,4R,5R)-3,4,5-trihydroxyoxolan-2-yl]methoxyphosphinic acid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMILES: | [H][C@@]1(O)O[C@]([H])(COP(O)(=O)OP(O)(=O)OC[C@@]2([H])O[C@@]([H])(N3C=NC4=C(N)N=CN=C34)[C@]([H])(O)[C@]2([H])O)[C@@]([H])(O)[C@@]1([H])O | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemical Taxonomy | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | belongs to the class of organic compounds known as pterins and derivatives. These are polycyclic aromatic compounds containing a pterin moiety, which consist of a pteridine ring bearing a ketone and an amine group to form 2-aminopteridin-4(3H)-one. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kingdom | Organic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Super Class | Organoheterocyclic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Class | Pteridines and derivatives | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sub Class | Pterins and derivatives | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Direct Parent | Pterins and derivatives | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alternative Parents |
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Substituents |
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Molecular Framework | Aromatic heteropolycyclic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Descriptors |
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Physical Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
State: | Solid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Charge: | -2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Melting point: | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental Properties: |
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Predicted Properties |
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Biological Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Locations: | Cytoplasm | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Reactions: | Adenosine diphosphate ribose + Water <> Adenosine monophosphate +2 Hydrogen ion + D-Ribose-5-phosphate Adenosine diphosphate ribose + Water <> Adenosine monophosphate + D-Ribose-5-phosphate Water + NAD <> Hydrogen ion + Adenosine diphosphate ribose + Niacinamide Adenosine diphosphate ribose + Water > Hydrogen ion + Adenosine monophosphate + D-Ribose-5-phosphate Adenosine diphosphate ribose + Water > Adenosine monophosphate + D-Ribose-5-phosphate Adenosine diphosphate ribose + Water <> Adenosine monophosphate +2 Hydrogen ion + D-Ribose-5-phosphate | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMPDB Pathways: | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG Pathways: |
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EcoCyc Pathways: |
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Concentrations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Find out more about how we convert literature concentrations. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Spectra | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Spectra: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References: |
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Synthesis Reference: | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Material Safety Data Sheet (MSDS) | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Links | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Links: |
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Enzymes
- General function:
- Involved in hydrolase activity, acting on acid anhydrides, in phosphorus-containing anhydrides
- Specific function:
- Acts on ADP-mannose and ADP-glucose as well as ADP- ribose. Prevents glycogen biosynthesis. The reaction catalyzed by this enzyme is a limiting step of the gluconeogenic process
- Gene Name:
- nudF
- Uniprot ID:
- Q93K97
- Molecular weight:
- 23667
Reactions
ADP-ribose + H(2)O = AMP + D-ribose 5-phosphate. |
- General function:
- Involved in hydrolase activity
- Specific function:
- Active on adenosine(5')triphospho(5')adenosine (Ap3A), ADP-ribose, NADH, adenosine(5')diphospho(5')adenosine (Ap2A)
- Gene Name:
- nudE
- Uniprot ID:
- P45799
- Molecular weight:
- 21153
Reactions
ADP-ribose + H(2)O = AMP + D-ribose 5-phosphate. |