D-Ribulose (ECMDB00621) (M2MDB000159)
Record Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Version | 2.0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Creation Date | 2012-05-31 10:27:55 -0600 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Update Date | 2015-06-03 15:53:32 -0600 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary Accession Numbers |
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Identification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Name: | D-Ribulose | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | Ribulose is a ketopentose - a monosaccharide containing five carbon atoms, and including a ketone functional group. D-ribulose is an intermediate in the fungal pathway for D-arabitol production. D-ribulose is the epimer of d-xylulose. (Wikipedia) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms: |
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Chemical Formula: | C5H10O5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Weight: | Average: 150.1299 Monoisotopic: 150.05282343 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Key: | ZAQJHHRNXZUBTE-NQXXGFSBSA-N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI: | InChI=1S/C5H10O5/c6-1-3(8)5(10)4(9)2-7/h3,5-8,10H,1-2H2/t3-,5-/m1/s1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CAS number: | 488-84-6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IUPAC Name: | (3R,4R)-1,3,4,5-tetrahydroxypentan-2-one | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Traditional IUPAC Name: | D-ribulose | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMILES: | OC[C@@H](O)[C@@H](O)C(=O)CO | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemical Taxonomy | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | belongs to the class of organic compounds known as pentoses. These are monosaccharides in which the carbohydrate moiety contains five carbon atoms. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kingdom | Organic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Super Class | Organic oxygen compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Class | Organooxygen compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sub Class | Carbohydrates and carbohydrate conjugates | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Direct Parent | Pentoses | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alternative Parents | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Substituents |
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Molecular Framework | Aliphatic acyclic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Descriptors |
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Physical Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
State: | Solid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Charge: | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Melting point: | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental Properties: |
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Predicted Properties |
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Biological Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Locations: | Cytoplasm | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Reactions: | Adenosine triphosphate + D-Ribulose <> ADP + D-Ribulose 5-phosphate D-Ribulose + Adenosine triphosphate > Hydrogen ion + D-Ribulose-1-phosphate + ADP D-arabinose <> D-Ribulose Adenosine triphosphate + L-Ribulose + D-Ribulose <> ADP + L-Ribulose 5-phosphate + D-Ribulose 5-phosphate D-Ribulose + Adenosine triphosphate + D-Ribulose > Adenosine diphosphate + Hydrogen ion + D-Ribulose-1-phosphate + ADP D-Ribulose + Adenosine triphosphate > D-Ribulose-1-phosphate + Adenosine monophosphate + Hydrogen ion D-arabinopyranose <> D-Ribulose | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMPDB Pathways: |
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KEGG Pathways: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EcoCyc Pathways: |
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Concentrations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Spectra | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Spectra: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References: |
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Synthesis Reference: | Drueckhammer, Dale G.; Durrwachter, J. Robert; Pederson, Richard L.; Crans, Debbie C.; Daniels, Lacy; Wong, Chi Huey. Reversible and in situ formation of organic arsenates and vanadates as organic phosphate mimics in enzymatic reactions: mechanistic inves | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Material Safety Data Sheet (MSDS) | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Links | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Links: |
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Enzymes
- General function:
- Involved in phosphotransferase activity, alcohol group as acceptor
- Specific function:
- ATP + L(or D)-ribulose = ADP + L(or D)- ribulose 5-phosphate
- Gene Name:
- araB
- Uniprot ID:
- P08204
- Molecular weight:
- 61089
Reactions
ATP + L(or D)-ribulose = ADP + L(or D)-ribulose 5-phosphate. |
- General function:
- Involved in phosphotransferase activity, alcohol group as acceptor
- Specific function:
- ATP + L-fuculose = ADP + L-fuculose 1- phosphate
- Gene Name:
- fucK
- Uniprot ID:
- P11553
- Molecular weight:
- 53235
Reactions
ATP + L-fuculose = ADP + L-fuculose 1-phosphate. |
- General function:
- Involved in L-fucose isomerase activity
- Specific function:
- Converts the aldose L-fucose into the corresponding ketose L-fuculose. Is also able to convert D-arabinose into D- ribulose, but this isomerase has a higher affinity for fucose and fuculose than for arabinose and ribulose, respectively
- Gene Name:
- fucI
- Uniprot ID:
- P69922
- Molecular weight:
- 64976
Reactions
L-fucose = L-fuculose. |
Transporters
- General function:
- Involved in transmembrane transport
- Specific function:
- Involved in the efflux of sugars. The physiological role may be the detoxification of non-metabolizable sugar analogs
- Gene Name:
- setC
- Uniprot ID:
- P31436
- Molecular weight:
- 43493