Thioredoxin (ECMDB23749) (M2MDB004174)
Record Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Version | 2.0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Creation Date | 2015-06-04 15:12:54 -0600 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Update Date | 2015-08-05 16:22:04 -0600 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary Accession Numbers |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Identification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Name: | Thioredoxin | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | Proteins that act as antioxidants by facilitating the reduction of other proteins by cysteine thiol-disulfide exchange | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms: |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemical Formula: | C9H16N3O2S | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Weight: | Average: 230.31 Monoisotopic: 230.095774361 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Key: | SSISHJJTAXXQAX-ZETCQYMHSA-O | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI: | InChI=1S/C9H15N3O2S/c1-12(2,3)7(8(13)14)4-6-5-10-9(15)11-6/h5,7H,4H2,1-3H3,(H2-,10,11,13,14,15)/p+1/t7-/m0/s1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CAS number: | 52500-60-4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IUPAC Name: | [(1S)-1-carboxy-2-(2-sulfanyl-1H-imidazol-4-yl)ethyl]trimethylazanium | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Traditional IUPAC Name: | [(1S)-1-carboxy-2-(2-sulfanyl-1H-imidazol-4-yl)ethyl]trimethylazanium | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMILES: | C[N+](C)(C)[C@@H](CC1=CNC(S)=N1)C(O)=O | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemical Taxonomy | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | belongs to the class of organic compounds known as histidine and derivatives. Histidine and derivatives are compounds containing cysteine or a derivative thereof resulting from reaction of cysteine at the amino group or the carboxy group, or from the replacement of any hydrogen of glycine by a heteroatom. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kingdom | Organic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Super Class | Organic acids and derivatives | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Class | Carboxylic acids and derivatives | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sub Class | Amino acids, peptides, and analogues | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Direct Parent | Histidine and derivatives | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alternative Parents | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Substituents |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Framework | Aromatic heteromonocyclic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Descriptors | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Physical Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
State: | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Charge: | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Melting point: | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental Properties: |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Properties |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Locations: | Cytoplasm | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Reactions: | Thioredoxin + NADP + Thioredoxin <> Thioredoxin disulfide + NADPH + Hydrogen ion + Thioredoxin disulfide Thioredoxin + Phosphoadenosine phosphosulfate + Thioredoxin disulfide <> Thioredoxin disulfide + Sulfite + Adenosine 3',5'-diphosphate + Thioredoxin 2'-Deoxyribonucleoside diphosphate + Thioredoxin disulfide + Water <> Ribonucleoside diphosphate + Thioredoxin Peptide-L-methionine + Thioredoxin disulfide + Water <> Peptide-L-methionine (R)-S-oxide + Thioredoxin Peptide-L-methionine + Thioredoxin disulfide + Water + L-Methionine <> Peptide-L-methionine (S)-S-oxide + Thioredoxin + L-methionine (S)-S-oxide 2'-Deoxyribonucleoside triphosphate + Thioredoxin disulfide + Water <> Ribonucleoside triphosphate + Thioredoxin dADP + Thioredoxin disulfide + Water <> Thioredoxin + ADP Thioredoxin + Phosphoadenosine phosphosulfate + Thioredoxin disulfide <> Sulfite + Adenosine 3',5'-diphosphate dATP + Thioredoxin disulfide + Water <> Adenosine triphosphate + Thioredoxin dGTP + Thioredoxin disulfide + Water <> Guanosine triphosphate + Thioredoxin Thioredoxin + NADP <> Thioredoxin disulfide + NADPH + Hydrogen ion Peptide-L-methionine + Thioredoxin disulfide + Water <> Peptide-L-methionine (R)-S-oxide + Thioredoxin Peptide-L-methionine + Thioredoxin disulfide + Water + L-Methionine <> Peptide-L-methionine (S)-S-oxide + Thioredoxin + L-methionine (S)-S-oxide dADP + Thioredoxin disulfide + Water <> Thioredoxin + ADP Peptide-L-methionine + Thioredoxin disulfide + Water + L-Methionine <> Peptide-L-methionine (S)-S-oxide + Thioredoxin + L-methionine (S)-S-oxide | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMPDB Pathways: |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG Pathways: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EcoCyc Pathways: | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Concentrations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Spectra | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Spectra: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References: | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synthesis Reference: | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Material Safety Data Sheet (MSDS) | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Links | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Links: |
|
Enzymes
- General function:
- Involved in oxidation-reduction process
- Specific function:
- Provides the precursors necessary for DNA synthesis. Catalyzes the biosynthesis of deoxyribonucleotides from the corresponding ribonucleotides. R1 contains the binding sites for both substrates and allosteric effectors and carries out the actual reduction of the ribonucleotide. It also provides redox- active cysteines
- Gene Name:
- nrdA
- Uniprot ID:
- P00452
- Molecular weight:
- 85774
Reactions
2'-deoxyribonucleoside diphosphate + thioredoxin disulfide + H(2)O = ribonucleoside diphosphate + thioredoxin. |
- General function:
- Involved in oxidation-reduction process
- Specific function:
- Thioredoxin + NADP(+) = thioredoxin disulfide + NADPH
- Gene Name:
- trxB
- Uniprot ID:
- P0A9P4
- Molecular weight:
- 34623
Reactions
Thioredoxin + NADP(+) = thioredoxin disulfide + NADPH. |
- General function:
- Involved in cysteine biosynthetic process from serine
- Specific function:
- O(3)-acetyl-L-serine + H(2)S = L-cysteine + acetate
- Gene Name:
- cysK
- Uniprot ID:
- P0ABK5
- Molecular weight:
- 34489
Reactions
O(3)-acetyl-L-serine + H(2)S = L-cysteine + acetate. |
3-chloro-L-alanine + thioglycolate = S-carboxymethyl-L-cysteine + chloride. |
- General function:
- Involved in cysteine biosynthetic process from serine
- Specific function:
- Two cysteine synthase enzymes are found. Both catalyze the same reaction. Cysteine synthase B can also use thiosulfate in place of sulfide to give cysteine thiosulfonate as a product
- Gene Name:
- cysM
- Uniprot ID:
- P16703
- Molecular weight:
- 32664
Reactions
O(3)-acetyl-L-serine + H(2)S = L-cysteine + acetate. |
- General function:
- Involved in phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin) activity
- Specific function:
- Reduction of activated sulfate into sulfite
- Gene Name:
- cysH
- Uniprot ID:
- P17854
- Molecular weight:
- 27976
Reactions
Adenosine 3',5'-bisphosphate + sulfite + thioredoxin disulfide = 3'-phosphoadenylyl sulfate + thioredoxin. |
- General function:
- Involved in catalytic activity
- Specific function:
- 2'-deoxyribonucleoside triphosphate + thioredoxin disulfide + H(2)O = ribonucleoside triphosphate + thioredoxin
- Gene Name:
- nrdD
- Uniprot ID:
- P28903
- Molecular weight:
- 80022
Reactions
2'-deoxyribonucleoside triphosphate + thioredoxin disulfide + H(2)O = ribonucleoside triphosphate + thioredoxin. |
- General function:
- Involved in oxidoreductase activity
- Specific function:
- Provides the precursors necessary for DNA synthesis. Catalyzes the biosynthesis of deoxyribonucleotides from the corresponding ribonucleotides. R2F contains the tyrosyl radical required for catalysis
- Gene Name:
- nrdF
- Uniprot ID:
- P37146
- Molecular weight:
- 36443
Reactions
2'-deoxyribonucleoside diphosphate + thioredoxin disulfide + H(2)O = ribonucleoside diphosphate + thioredoxin. |
- General function:
- Involved in oxidation-reduction process
- Specific function:
- Provides the precursors necessary for DNA synthesis. Catalyzes the biosynthesis of deoxyribonucleotides from the corresponding ribonucleotides. R1E contains the binding sites for both substrates and allosteric effectors and carries out the actual reduction of the ribonucleotide
- Gene Name:
- nrdE
- Uniprot ID:
- P39452
- Molecular weight:
- 80478
Reactions
2'-deoxyribonucleoside diphosphate + thioredoxin disulfide + H(2)O = ribonucleoside diphosphate + thioredoxin. |
- General function:
- Involved in oxidoreductase activity
- Specific function:
- Provides the precursors necessary for DNA synthesis. Catalyzes the biosynthesis of deoxyribonucleotides from the corresponding ribonucleotides. R2 contains the tyrosyl radical required for catalysis
- Gene Name:
- nrdB
- Uniprot ID:
- P69924
- Molecular weight:
- 43517
Reactions
2'-deoxyribonucleoside diphosphate + thioredoxin disulfide + H(2)O = ribonucleoside diphosphate + thioredoxin. |